Logica dei Sistemi

In questo breve articolo vengono presentate alcune ontologie in campo biomedico allo scopo di fornire un semplice schema descrittivo di cosa è oggi disponibile.

Essendo il settore ontologico in piena espansione ci si focalizzerà su due casi particolari da cui potranno essere estrapolate delle considerazioni di carattere generale.

Il primo progetto è quello della Open Biological and Biomedical Ontologies, meglio noto come OBO Foundry. Il secondo è il progetto GALEN.

Entrambi i progetti hanno l'obiettivo di mettere a disposizione delle ontologie biomediche, anche se con delle differenze che saranno più chiare nel seguito.

Open Biological and Biomedical Ontologies

Il progetto OBO Foundry consiste nella collaborazione di numerosi sviluppatori di ontologie con il fine di stabilire un insieme di principi per la loro costruzione con l'obiettivo di creare un insieme (libreria) di ontologie tra loro ortogonali e interoperabili in campo biologico e biomedico.

Al momento le ontologie che fanno parte della OBO Foundry sono le seguenti:processi biologici, componenti cellulari, entità chimiche di interesse biologico, funzioni molecolari, qualità fenotipica, proteine, anatomia e sviluppo di Xenopus e Zebrafish.Oltre a queste ontologie ve ne sono altre che potrebbero in futuro essere inserite nel progetto o, comunque, di interesse.